Cómputo de modos elementales de flujo mediante generación de columnas
Palabras clave:
generación de columnas, modos elementales de flujo, redes metabólicasResumen
La identificación de modos de flujo elementales en redes metabólicas a escala genómica es dificultosa debido a la naturaleza combinatoria del problema. Sin embargo, en biología de sistemas, el modelado basado en restricciones utiliza solo unos pocos modos de flujo elementales relevantes. Por ello, su cálculo mediante optimización se está convirtiendo en una tendencia reciente. Desarrollamos un algoritmo basado en el paradigma de generación de columnas para el cálculo de modos de flujo elementales que permite un ahorro considerable de tiempo computacional en comparación con enfoques previos. El algoritmo demostró ser capaz de generar eficientemente modos de flujo elementales para redes metabólicas a escala genómica con miles de reacciones intracelulares.
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Derechos de autor 2025 Homero Basso, Rodolfo G. Dondo
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