Metodologías para la detección de SARS-CoV-2 y análisis de carga viral mediante RT-PCR cuantitativa

Autores/as

  • Carolina Jaquenod De Giusti Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Mauro Montanaro Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • Maria Victoria Mencucci Centro de Endocrinología Experimental y Aplicada (CENEXA-CONICET-UNLP)
  • Romina Canzoneri Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas (CINIBA-UNLP)
  • Alejandro Orlowski Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Marianela Santana Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • Erica Pereyra Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Mauricio Kraemer Centro de Endocrinología Experimental y Aplicada (CENEXA-CONICET-UNLP)
  • Sabrina María Luisa Lavarías Instituto de Limnología de La Plata (ILPLA-CONICET-UNLP)
  • Verónica Moscoso Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • Noelian Costantini Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Flavio Francini Centro de Endocrinología Experimental y Aplicada (CENEXA-CONICET-UNLP)
  • Horacio Garda Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • Nicolás Pedríni Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • María Gonzalez Baro Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  • Martin Vila Petroff Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Alejandro Aiello Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  • Martin Abba CINIBA, Facultdad de Cienicas Médicas, UNLP

DOI:

https://doi.org/10.24215/26838559e013

Palabras clave:

SARS-CoV-2, COVID-19, detección, carga viral, PCR cuantitativa

Resumen

En diciembre de 2019, se produjo un nuevo brote de enfermedad por coronavirus (COVID-19) en Wuhan, China. El síndrome respiratorio agudo severo-coronavirus-2 (SARS-CoV-2), que es el séptimo coronavirus conocido que infecta a los humanos, es altamente infeccioso y se ha expandido rápidamente en todo el mundo desde su descubrimiento. El diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 se basa en la detección del genoma viral (ARN) a través de técnicas de biología molecular. Con este fin, se extrae el ARN total para su posterior detección mediante PCR cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR). Las pruebas cuantitativas de ácidos nucleicos se han convertido en el “estándar de oro” para el diagnóstico y guía en la toma de decisiones clínicas. Sin embargo, los ensayos de RT-qPCR dirigidos al SARS-CoV-2 tienen varios desafíos, especialmente en términos de diseño de cebadores / sondas y de desarrollo de metodologías que permitan estimar la carga viral en pacientes con diagnóstico de COVID-19.

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Citas

Lupia, T., Scabini, S., Pinna, S.M., Di Perri, G., De Rosa, F.G., Corcione, S. (2020). 2019-novel coronavirus outbreak: A new challenge. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 21, 22-27. https://doi.org/10.1016/j.jgar.2020.02.021

Mahase, E. (2020) Covid-19: most patients require mechanical ventilation in first 24 hours of critical care. BMJ, 368:m1201. https://doi.org/10.1136/bmj.m1201

Rhee, C., Kanjilal, S., Baker, M., Klompas, M. (2020) Duration of SARS-CoV-2 Infectivity: When is it Safe to Discontinue Isolation? Clinical Infectious Diseases, ciaa1249. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1249

Chu, C.M., Poon, L.L., Cheng, V.C., Chan, K.S., Hung, I.F., Wong, M.M., Chan, K.H., Leung, W.S., Tang, B.S., Chan, V.L. y Ng, W.L. (2004) Initial viral load and the outcomes of SARS. CMAJ, 171 (11): 1349-1352. https://doi.org/10.1503/cmaj.1040398

Liu, Y., Yang, Y., Zhang, C., Huang, F., Wang, F., Yuan, J., Wang, Z., Li, J., Li, J., Feng, C. y Zhang, Z. (2020) Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury. Science China Life Sciences, 63 (3): 364-374. https://doi.org/10.1007/s11427-020-1643-8

Park, M., Won, J., Choi, B.Y. y Lee, C.J. (2020) Optimization of primer sets and detection protocols for SARS-CoV-2 of coronavirus disease 2019 (COVID-19) using PCR and real-time PCR. Experimental & Molecular Medicine, 52 (6): 963-77. https://doi.org/10.1038/s12276-020-0452-7

Bustin, S. y Huggett, J. (2017) qPCR primer design revisited. Biomolecular Detection and Quantification, 14:19-28. https://doi.org/10.1016/j.bdq.2017.11.001

Li, D., Zhang, J. y Li, J. (2020) Primer design for quantitative real-time PCR for the emerging Coronavirus SARS-CoV-2. Theranostics, 10 (16): 7150. https://doi.org/10.7150/thno.47649

Pan, Y., Zhang, D., Yang, P., Poon, L.L. y Wang, Q. (2020) Viral load of SARS-CoV-2 in clinical samples. The Lancet Infectious Diseases, 20 (4): 411-412. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(20)30113-4

Yu, F., Yan, L., Wang, N., Yang, S., Wang, L., Tang, Y., Gao, G., Wang, S., Ma, C., Xie, R. y Wang, F. (2020) Quantitative detection and viral load analysis of SARS-CoV-2 in infected patients. Clinical Infectious Diseases, 71 (15), 793–798,. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa345

Keyaerts, E., Vijgen, L., Maes, P., Duson, G., Neyts, J., Van Ranst, M. (2006) Viral load quantitation of SARS-coronavirus RNA using a one-step real-time RT-PCR. International Journal of Infectious Diseases, 10 (1): 32-37. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2005.02.003

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Publicado

2020-12-11

Cómo citar

Jaquenod De Giusti, C., Montanaro, M., Mencucci, M. V., Canzoneri, R., Orlowski, A., Santana, M., Pereyra, E., Kraemer, M., Lavarías, S. M. L., Moscoso, V., Costantini, N., Francini, F., Garda, H., Pedríni, N., Gonzalez Baro, M., Vila Petroff, M., Aiello, A., & Abba, M. (2020). Metodologías para la detección de SARS-CoV-2 y análisis de carga viral mediante RT-PCR cuantitativa. Innovación Y Desarrollo Tecnológico Y Social, 2(2), 1–14. https://doi.org/10.24215/26838559e013

Número

Vol. 2 Núm. 2 (2020): Número especial COVID-19

Sección

Artículos

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