Estimación de mestizaje en dos poblaciones venezolanas usando marcadores informativos de ancestralidad y haplogrupos de ADN mitocondrial
DOI:
https://doi.org/10.24215/18536387e035Palabras clave:
mestizaje, poblaciones venezolanas, marcadores de ancestralidad, ADN mitocondrialResumen
Los marcadores informativos de ancestralidad (AIM) autosómicos y los del ADN mitocondrial (ADNmt) son muy útiles para identificar el origen y los patrones de migración de las poblaciones. En este trabajo se estimó el mestizaje a partir de siete AIM en 188 individuos venezolanos, 84 del estado Guárico y 104 de la región centro occidental de Venezuela (RCO), se estimó la ancestralidad mitocondrial en el estado Guárico y se compararon ambas poblaciones según su origen y desarrollo histórico. Este estudio representa la primera aproximación a la composición genética de Guárico y es el primer reporte para Venezuela utilizando marcadores tipo AIM. Los resultados revelaron que los aportes amerindio y europeo predominan en estas poblaciones, pero el amerindio es mayor en Guárico (50,57 %) que en RCO (44,92 %), y el europeo lo es en RCO (38,46 % vs. 33,72 %). El origen del ADNmt en Guárico es de predominio amerindio (80 %), tendencia similar a lo reportado para RCO (75 %). El aporte amerindio en Guárico es el más alto reportado para Venezuela. Se concluye que las diferencias encontradas entre ambas muestras podrían deberse a la colonización más temprana de la RCO y a su desarrollo industrial moderado durante el siglo XIX. Así mismo, planteamos que los AIM aquí utilizados lograron una buena discriminación del aporte de los tres grupos ancestrales principales y que su uso simultáneo con polimorfismos de origen uniparental permite obtener, en forma económica, una mejor aproximación genética para explicar la dinámica del proceso de mestizaje que dio origen a la población venezolana actual.
Descargas
Métricas
Citas
Acosta Loyo, M., Castro de Guerra, D., Izaguirre, M.H. y Rodríguez-Larralde, A. (2004). Admixture estimates for Churuguara, a Venezuelan town in the state of Falcón. Annals of Human Biology, 31, 669-680. doi:10.1080/03014460400019760
Antunez de Mayolo, G., Antunez de Mayolo, A., Antunez de Mayolo, P., Papiha, S. S., Hammer, M., Yunis, J. J.,…Herrera, R. J. (2002). Phylogenetics of worldwide human populations as determined by polymorphic Alu insertions. Electrophoresis 23, 3346-56. doi:10.1002/1522-2683(200210)23:19<3346::AID-ELPS3346>3.0.CO;2-J
Arcila Farías, E. (1946). Economía Colonial de Venezuela. Fondo de Cultura Económica. México.
Bailliet, G., Rothhammer, F., Carnese, F., Bravi, C. M. y Bianchi, N. (1994). Founder mitochondrial haplotypes in amerindian populations. American Journal of Human Biology, 54, 27-33.
Bastos-Rodrígues, L., Pimenta, J. R. y Pena S. D. J. (2006). The genetic structure of human populations studied through short insertion-deletion polymosphisms. Annals of Human Genetics, 70, 658-665. doi:10.1111/j.1469-1809.2006.00287.x
Battilana, J., Fagundez, N. J. R., Heller, A. H., Goldani, A., Freitas, L. B., Tarazona-Santos, E.,… Bonatto, S. L. (2006). Alu insertion polymorphisms in Native Americans and related Asian populations. Annals of Human Biology 33, 142-160. doi:10.1080/03014460500487347
Batzer, M. A., Arcot, S. S., Phinney, J. W., Alegria-Hartman, M., Kass, D., Milligan, S. M.,… Stoneking, M. (1996). Genetic variation of recent Alu insertions in human populations. Journal of Molecular Evololution, 42, 22-29.
Bonilla, C., Parra, E., Pfaff, C. L., Dios, S., Marshall, J. A., Hamman, R. F.,… Shriver M. P. (2004). Admixture in the hispanic of the San Luis, Colorado and its implications for complex trail gene mapping. Annals of Human Genetics, 68, 139-153. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00084.x
Brito Figueroa, F. (1966). Historia económica y social de Venezuela, una estructura para su estudio. Caracas, Venezuela: Dirección de Cultura, Universidad Central de Venezuela.
Castro de Guerra, D., Figuera Pérez, C., Izaguirre, M. H., Arroyo Barahona, E., Rodríguez-Larralde, A. y Vivenes de Lugo, M. (2011). Gender differences in ancestral contribution and admixture in Venezuelan populations. Human Biology, 83, 345-361. doi:10.3378/027.083.0302
Castro de Guerra, D. y Suarez, M. (2010). Sobre el proceso de mestizaje en Venezuela. Interciencia, 35(9), 654-658.
Chakraborty, R. (1986). Admixture in human populations: model and predictions. Yearbook of Physical Anthropology, 29, 1-43.
Díaz-Rousseau, G. A., García, A. y Demarchi, D. A. (2019). Análisis de la estructura genética del Valle de Traslasierra a partir de inserciones Alu. Revista Argentina de Antropología Biológica, 21(1). doi:10.17139/raab.2019.0021.01.03
Dornelles, C. L., Battilana, J., Fagundes, N. J. R., Freitas, L. B., Bonatto, S. L., y Salano, S. L. (2004). Mitochondrial DNA and Alu insertions in a genetically peculiar population: The Ayoreo Indians of Bolivia and Paraguay. American Journal of Human Biology 16, 479-488. doi:10.1002/ajhb.20038
Gaya-Vidal, M., Dugoujon, J. M., Esteban, E., Athanasiadis, G., Rodríguez, A., Villena, M.,…Moral, P. (2010). Autosomal and X chromosome Alu insertions in Bolivian Aymaras and Quechuas: Two laguages and one genetic pool. American Journal Human Biology 22, 154-62. doi:10.1002/ajhb.20967
Galanter, J. M., Fernandez-Lopez, J. C., Gignoux, C., Barnholtz-Sloan, J., Fernandez-Rozadilla, C., Via, M.,… Carracedo, A. (2012). Development of a panel of genome-wide ancestry informative markers to study admixture throughout the Americas. PLoS Genetics, 8(3), e1002554. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1002554
García-Obregón, S., Alfonso-Sánchez, M. A., Pérez-Miranda, A. M., Vidales, C., Arroyo, D., Peña, J. A. (2006). Genetic position of Valencia (Spain) in the Mediterranean basin according to Alu insertions. American Journal of Human Biology 18, 187-95. doi:10.1002/ajhb.20487
Gómez-Pérez, L., Alfonso-Sánchez, M. A., Pérez-Miranda, A. M., de Pancorbo, M. M. y Peña, J. (2007). Utilidad de las inserciones Alu en los estudios de mestizaje. Antropo, 14, 29-36.
Herrera, R. J., Rojas, D. P., Terreros, M. C. (2007). Polymorphic Alu insertions among Mayan populations. Journal of Human Genetics, 52, 129-142. doi:10.1007/s10038-006-0089-y
Homburger, J. R., Moreno-Estrada, A., Gignoux, C. R., Nelson, D., Sanchez, E., Ortiz-Tello, P.,… Bustamante, C. D. (2015) Genomic insights into the ancestry and demographic history of South America. PLoS Genetic, 11(12), e1005602. doi:10.1371/journal.pgen.1005602
Kassambara, A., y Mundt, F. (2016). Factoextra: Extract and visualize the results of multivariate data analyses. Recuperado de https://rpkgs.datanovia.com/factoextra/index.html
Lahiri, D. K. y Nurnberger, J. L. Jr. (1991). A rapid non-enzymatic method for the preparation of HMW DNA from blood for RFLP studies. Nucleic Acids Research, 19, 5444.
Lê, S., Josse, J. y Husson, F. (2008). FactoMineR: An R package for multivariate analysis. Journal of Statistical Software, 25(1). doi:10.18637/jss.v025.i01
Luizon, M. R., Mendes-Junior, C. T., De Oliveira, S. F, and Simões, A. L. (2008). Ancestry informative markers in amerindians from Brazilian Amazon. American Journal of Human Biology, 20, 86-90. doi:10.1002/ajhb.20681
Martínez, A. (2005). Mi Estado Guárico. San Juan de los Morros. Ediciones Ince Guárico. Gráficas Los Morros, CA.
Martínez, H., Rodríguez-Larralde, A., Izaguirre, M. H. y Castro de Guerra, D. (2007). Admixture estimates for Caracas, Venezuela, based on autosomal, Y-chromosome and mtDNA markers. Human Biology, 79, 201-213. doi:10.1353/hub.2007.0032
Martínez-Marignac, V. L., Sans, M., Pucciarelli, H. M., Bianchi, N. O. (2002). Estimación de la mezcla génica en descendientes de africanos de la ciudad de Melo, Uruguay, a través de marcadores autosómicos asociados o específicos de poblaciones. Revista Argentina de Antropología Biológica, 4, 49-59.
Martínez-Marignac, V. L., Valladares, A., Cameron, E., Chan, A., Perera, A., Globus-Goldberg, R.,…Parra, E. J. (2007). Admixture in Mexico City: implications for admixture mapping of type 2 diabetes genetic risk factors. Human Genetics, 120, 807-819. doi: 10.1007/s00439-006-0273-3
Mesa, N. R., Mondragón, M. C., Soto, I. D., Parra, M. V., Duque, C., Ortíz-Barrientos, D.,... Ruiz-Linares, A. (2000). Autosomal, mtDNA, and Y-chromosome diversity in Amerinds: Pre-and post-Columbian pattern of gene flow in South America. American Journal of Human Genetics, 67, 1277-1286. doi:10.1016/S0002-9297(07)62955-3
Mesa, N. R., Mondragón, M.C., Soto, I.D., Parra, M.V., Duque, C., Ortíz-Barrientos, D.,… Ruiz-Linares, A. (2000). Autosomal, mtDNA, and Y-chromosome diversity in Amerinds: Pre-and post-Columbian pattern of gene flow in South America. American Journal of Human Genetics, 67, 1277-1286. doi:10.1016/S0002-9297(07)62955-3
Mateus Pereira, L. H., Socorro, A., Fernandez, I., Masleh, M., Vidal, D., Bianchi, N. O.,… Herrera, R. J. (2005). Phylogenetic information in polymorphic L1 and Alu insertions from East Asians and Native American Populations. American Journal of Physical Anthropology, 128, 171-184. doi: 10.1002/ajpa.10441
NCBI. National Center of Biotechnology Information. Recuperado de http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Parra, E. J., Marcini, A., Akey, J., Martinson, J., Batzer, M. A., Cooper, R.,… Shriver, M. D. (1998). Estimating african american admixture proportions by use of population-specific alleles. American Journal of Human Genetics, 63, 1839-1851. doi:10.1086/302148
Pinto-Cisternas, J., Zimmer, E. y Barrai I. (1990). Comparisons of Lasker’s coefficient of relationship in a Venezuelan town in two different periods. Annals of Human Biology, 17, 305-314. doi:10.1080/03014469000001082
Price, A. L., Patterson, N., Yu, F., Cox, D. R., Waliszewska, A., McDonald, G. J.,… Reich, D. (2007). A genomewide admixture map for Latino populations. American Journal of Human Genetics, 80, 1024-1036. doi:10.1086/518313
Read, T. y Schull, W. J. (1968). A general maximun likelihood method estimation program. American Journal of Human Genetics, 20, 579-580.
Schorck, M. A. y Remington, R. D. (2000). Statistics with applications to the biological and health sciences. New Jersey, United States: Prentice Hall.
Rizzatti Luizon, M., Mendes-Junior, C. T., De Oliveiro, S. F. y Simöes, A. L. (2008). Ancestry informative markers in Amerindians from Brazilian Amazon. American Journal of Human Biology, 20, 86-90. doi:10.1002/ajhb.20681
Rodríguez, A. (1994). El Estado Guárico. Orígenes, Mundo y Gente. Comisión Regional Conmemorativa de V Centenario del Encuentro de dos Mundos. República de Venezuela. Estado Guárico
Rodríguez-Larralde, A., Castro de Guerra, D., González-Coira, M. y Morales, J. (2001). Frecuencia génica y porcentaje de mezcla en diferentes áreas geográficas de Venezuela, de acuerdo a los grupos Rh y ABO. Interciencia, 26, 8-12.
Royal, Ch. D., Novembre, J., Fullerton, S., Goldstein, D. B., Long, J. C., Bamshad, M. J.,… Clark, A. G. (2010). Inferring genetic ancestry: opportunities, challenges and implications. American Journal of Human Genetics, 86, 661-673. doi:10.1016/j.ajhg.2010.03.011
Sans M. (2000). Admixture studies in Latin America: from the 20th to the 21th Century. Human Biology, 72, 155-177.
Salzano, F. M. y Sans, M. (2014). Interethnic admixture and the evolution of Latin American populations. Genetics and Molecular Biology, 37, 151-170. doi:10.1590/s1415-47572014000200003
Shriver, M. D., Smith, M. W., Jin, L., Marcini, A., Akey, J. M., Deka, R.,… Ferrell, R. E. (1997). Ethnic-affiliation estimation by use of population-specific DNA markers. American Journal of Human Genetics, 60, 957-964.
Silvia-Zolezzi, I., Hidalgo Miranda, A., Estrada Gil, J., Fernández López, J. C., Uribe Figueroa, L., Contreras, A.,… Jiménez-Sánchez, G. (2009). Analysis of genomic diversity in Mexican mestizo populations to develop genomic medicine in Mexico. Proceding National Academy of Science, 106, 8611-8616. doi:10.1073/pnas.0903045106
Simmons, A. D., Rodríguez-Arroyo, G. y Rodríguez-Larralde, A. (2007). Admixture estimates based on ABO, Rh and nine STRs in two Venezuelan regions. Annals of Human Biology, 34, 56-67. doi:10.1080/03014460601075736
Stoneking, M., Fontius, J. J., Clifford, S. L., Soodyall, H., Arcot, S. S., Saha, N., Jenkins, T.,… Batzer, M. (1997). Alu insertion polymorphisms and human evolution: Evidence for a larger population size in Africa. Genome Research 7, 1061-107. doi: 10.1101/gr.7.11.1061
Tarble, K. y Zucchi, A. (1984). Nuevos datos sobre la arqueología tardía del Orinoco: la serie Valloide. Acta Científica Venezolana, 35, 434-45.
Toro-Labrador, G., Wever, O. y Martínez Cruzado, J. C. (2003). Mitochondrial DNA analysis in Aruba: strong maternal ancestry of closely related Amerindians and implications for the peopling of Northwestern Venezuela. Caribbean Journal of Science, 39, 11-22.
Vila, M. A. (1965). Aspectos Geográficos del Estado Guárico. Corporación Venezolana de Fomento. Serie “Monografías Estadales”. Caracas.
Wang, S., Lewis, C. M., Jakobsson, M., Ramachandran, S., Ray, N., Bedoya, G.,… Ruiz-Linares, A. (2007). Genetic variation and population structure in Native Americans. PLoS Genetics, 3, e185. doi:10.1371/journal.pgen.0030185
Descargas
Archivos adicionales
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
La RAAB es una revista de acceso abierto tipo diamante. No se aplican cargos para la lectura, el envío de los trabajos ni tampoco para su procesamiento. Asímismo, los autores mantienen el copyright sobre sus trabajos así como también los derechos de publicación sin restricciones.
