Información molecular obtenida a partir de pieles de la colección del Museo Regional Fagnano, Río Grande, Tierra del Fuego / Molecular data from furs belonging to the Fagnano Regional Museum collection, Río Grande, Tierra del Fuego
Resumen
En el presente trabajo se aplicaron técnicas moleculares sobre muestras poco conservadas de pieles depositadas en la colección del Museo Regional Monseñor Fagnano, Tierra del Fuego, Argentina, con el objetivo de identificar la especie con la que fueron confeccionadas. Se extrajeron pelos de mantas realizadas con pieles de guanaco (Lama guanicoe) por Selk’nam y de una piel de puma (Puma concolor) procedente de la provincia de Santa Cruz. Ambas muestras se encontraban almacenadas en el Museo Regional Monseñor Fagnano y en la Misión Salesiana Candelaria en Rio Grande, Tierra del Fuego, Argentina. La extracción de ADN de los fragmentos de pelos de 5mm de longitud se realizó en un buffer de lisis PCR-compatible. Se amplificaron por PCR fragmentos específicos de ADN mitocondrial y se secuenciaron. Las secuencias fueron comparadas con las depositadas en la base de secuencias de nucleótidos del National Center for Biotechnology Information (NCBI) de Estados Unidos. La aplicación de técnicas moleculares permitió recuperar secuencias de ADN de muestras de pieles con un estado de conservación poco óptimo para análisis genéticos, pudiendo extenderse a otras fuentes de pelos como las fibras textiles de origen arqueológico de la región.
Palabras clave: ADN antiguo; pelo; arqueología ambiental
Molecular techniques were applied to samples from poorly preserved furs deposited in the collection of Monseñor Fagnano Regional Museum in Tierra del Fuego, Argentina, in order to identify the species from which they were made. Hairs were obtained from guanaco leather blankets (Lama guanicoe) and a puma fur (Puma concolor) made by Selk'nam from Santa Cruz province. Both samples have been kept in the warehouse of Monseñor Fagnano Regional Museum at the Candelaria Salesian Mission in Río Grande, Tierra del Fuego, Argentina. For DNA extraction, 5-mm hair strands were digested in a PCR-compatible lysis buffer. Specific mitochondrial DNA fragments were amplified by PCR and sequenced. Nucleotide sequences were compared with those deposited in the National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA: GenBank. The use of molecular techniques allowed us to recover sequences from poorly preserved fur samples. This can be extended to other sources of hairs and fibers of archaeological origin in the area.
Keywords: Ancient DNA; hair; environmental archaeology
Descargas
Métricas
Citas
Baker LE. 2001. Mitochondrial DNA haplotype and sequence analysis of historic Choctaw and Menominee hair shaft samples. Tesis Doctoral Inédita. Universidad de Tennessee. Knoxville. USA.
Bonnichsen R, Hodges L, Ream W, Field K, Kirner DL, Selsor K, Taylor RE. 2001. Methods for the study of ancient hair: radiocarbon dates and gene sequences from individual hairs. J Archeol Sci 28:775-785. doi:10.1006/jasc.2000.0624
Brandt LØ, Tranekjerv LD, Mannering U, Ringgaard M, Frei KM, Willerslev E, Gleba M, Gilbert MTP. 2011. Characterising the potential of sheep wool for ancient DNA analyses. Archaeol Anthropol Sci 3:209-221. doi:10.1007/s12520-011-0055-2
Chehébar C, Martín S. 1989. Guía para el reconocimiento microscópico de los pelos de los mamíferos de la Patagonia. Doñana, Acta Vertebr 16:247-291.
Cooper A, Poinar HN. 2000. Ancient DNA: do it right or not at all. Science 289:1139-1141. doi:10.1126/science.289.5482.1139b
Drancourt M, Raoult D. 2005. Palaeomicrobiology: current issues and perspectives. Nat Rev Microbiol 3:23-35. doi:10.1038/nrmicro1063
Farrell LE, Romant J, Sunquist ME. 2000. Dietary separation of sympatric carnivores identified by molecular analysis of scats. Mol Ecol 9:1583-1590. doi:10.1046/j.1365-294x.2000.01037.x
Foran DR, Minta SC, Heinemeyer KS. 1997. DNA-based analysis of hair to identify species and individuals for population research and monitoring. Wildl Soc Bull 25(4):840-847.
Fugassa MH, Cicchino A, Sardella NH, Guichón RA, Denegri GM, Araujo A. 2007a. Nuevas fuentes de evidencia para la paleoparasitología y la antropología biológica en Patagonia. Rev Arg Antrop Biol 9(2):51-57.
Fugassa MH, Sardella NH, Denegri GM. 2007b. Paleoparasitological analysis of a raptor pellet from Southern Patagonia. J Parasitol 93:421-422. doi:10.1645/GE989R.1
Fugassa MH, Sardella NH, Guichón RA, Denegri GM, Araujo A. 2008. Paleoparasitological analysis applied to skeletal sediments of meridional patagonian collections. J Archaeol Sci 35:1408-1411. doi:10.1016/j.jas.2007.10.006
Fulton TL. 2012. Setting up and ancient DNA laboratory. En: Shapiro B, Hofreiter M, editores. Ancient DNA. Methods and protocols. New York: Human Press. p 1-12. doi:10.1007/978-1-61779-516-9_1
Gilbert MTP, Menez L, Janaway RC, Tobin DJ, Cooper A, Wilson AS. 2006. Resistance of degraded hair shafts to contaminant DNA. Forensic Sci Int 156:208-212. doi:10.1016/j.forsciint.2005.02.021
Gilbert MTP, Drautz DI, Lesk AM, Ho SYW, Qic J, Ratan A, Hsu CH, Sher A, Dalén L, Götherström A, Tomsho LP, Rendulic S, Packard M, Campos PF, Kuznetsova TV, Shidlovskiy F, Tikhonov A, Willerslev E, Iacumin P, Buigues B, Ericson PGP, Germonpré M, Kosintsev P, Nokolaev V, Nowak-Kemp M, Knight JR, Irzyk JP, Perbost CS, Fredrikson KM, Harkins TT, Sheridan SH, Miller, Schuster SC. 2008a. Intraspecific phylogenetic analysis of Siberian woolly mammoths using complete mitochondrial genomes. Proceed Natl Acad Sci USA 105:8327-8332. doi: 10.1073/pnas.0802315105
Gilbert MTP, Kivisild T, Gronnow B, Andersen PK, Metspalu E, Reidla M, Tamm E, Axelsson E, Götherström A, Campos PF, Rasmussen M, Metspalu M, Higham TFG, Schwenninger J, Nathan R, De Hoog C, Koch A, Moller LN, Andreasen C, Meldgaard M, Villems R, Bendixen CH, Wilillerslev E. 2008b. Paleo-Eskimo mtDNA genome reveals matrilineal discontinuity in Greenland. Science 320:1787-1789. doi:10.1126/science.1159750
Henry P, Henry A, Russello MA. 2011. A noninvasive hair sampling technique to obtain high quality DNA from elusive small mammals. J Vis Exp 49:2791. doi:10.3791/2791
Higuchi R, Von Beroldingen CH, Sensabaugh GF, Erlich HA. 1988. DNA typing from single hairs. Nature 332:543-546. doi:10.1038/332543a0
Hofreiter M. 2012. Nondestructive DNA extraction from museum specimens. En: Shapiro B, Hofreiter M, editores. Ancient DNA. Methods and protocols. New York: Human Press. p 93-100.
Hofreiter M, Serre D, Poinar HN, Kuch M, Paabo S. 2001. Ancient DNA. Nat Rev Genetic 2:353-359. doi:10.1038/35072071
Petrigh RS, Fugassa MH. 2013. Molecular identification of a Fuegian dog belonging to the Fagnano regional Museum ethnographic collection, Tierra del Fuego. Quaternary Int 317:14-18. doi:10.1016/j.quaint.2013.07.030
Pfeiffer I, Volkel I, Taubert H, Brenig B. 2004, Forensic DNA-typing of dog hair: DNA-extraction and PCR amplification. Forensic Sci Int 141:149-151. doi:10.1016/j.forsciint.2004.01.016
Rasmussen M, Li Y, Lindgreen S, Pedersen JS, Albrechtsen A, Moltke I, Metspalu M, Metspalu E, Kivisild T, Gupta R, Bertalan M, Nielsen K, Gilbert MTP, Wang Y, Raghavan M, Campos PF, Kamp HM, Wilson AS, Gledhill A, Tridico S, Bunce M, Lorenzen ED, Binladen J, Guo X, Zhao J, Zhang X, Zhang H, Li Z, Chen M, Orlando L, Kristiansen K, Bak M, Tommerup N, Bendixen CH, Pierre TL, Gronnow B, Meldgaard M, Andreasen C, Fedrova SA, Osipova LP, Higham TFG, Ramsey CHB, Hansen TVO, Nielsen FC, Crawford MH, Brunak S, Sicheritz-Pontén T, Villems R, Nielsen R, Krogh A, Wang J, Willerslev E. 2010. Ancient human genome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo. Nature 463:757-762. doi:10.1038/nature08835
Roques BA, Chavez C, Keller C, Magnusson WE, Palomares F, Godoy JA. 2011. Identification of Neotropical felid faeces using RCP-PCRS. Mol Ecol Resour 11:171-175. doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02878.x
Schneider PM, Seo Y, Rittner C. 1999. Forensic mtDNA hair analysis excludes a dog from having caused a traffic accident. Int J Legal Med 112:315-316. doi:10.1007/s004140050257
Subramanian S, Karthik T, Vijayaraaghavan NN. 2005. Single nucleotide polymorphism for animal fibre identification. J Biotechnol 116:153-158. doi:10.1016/j.jbiotec.2004.10.015
van Asch B, Albarran C, Alonso A, Angulo R, Alves C, Betancor E, Catanesi CI, Corach D, Crespillo M, Doutremepuich CH, Estonba A, Fernandes AT, Fernandez E, Garcia AM, Garcia MA, Gilardi P, Gonçalves R, Hernandez A, Lima G, Nascimento E, De Pancorbo MM, Parra D, Pinheiro MF, Prat E, Puente J, Ramirez JL, Rendo F, Rey I, Di Rocco F, Rodriguez A, Sala A, Salla J, Sanchez JJ, Sola D, Silvam S, Pestano Brito JJ, Amorim A. 2009. Forensic analysis of dog (Canis lupus familiaris) mitochondrial DNA sequences: an inter-laboratory study of the GEP-ISFG working group. Forensic Sci Int: Genetics 4:49-54. doi:10.1016/j.fsigen.2009.04.008
Vigilant L, Pennington R, Harpending H, Kocher TD, Wilson AC. 1989. Mitochondrial DNA sequences in single hairs from a southern African population. Proc Natl Acad Sci USA 86(23):9350-9354. doi:10.1073/pnas.86.23.9350
Weinstock J, Shapiro B, Prieto A, Marin JC, Gonzalez BA, Gilbert MTP, Willerslev E. 2009. The Late Pleistocene distribution of vicuñas (Vicugna vicugna) and the ‘‘extinction’’ of the gracile llama (‘‘Lama gracilis’’): new molecular data. Quat Sci Rev 28:1369-1373. doi:10.1016/j.quascirev.2009.03.008
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
La RAAB es una revista de acceso abierto tipo diamante. No se aplican cargos para la lectura, el envío de los trabajos ni tampoco para su procesamiento. Asímismo, los autores mantienen el copyright sobre sus trabajos así como también los derechos de publicación sin restricciones.
