Caracterización molecular en el género Mecardonia Ruiz & Pav. (Plantaginaceae) utilizando marcadores ISSR
Palabras clave:
variabilidad genética, germoplasma ornamental nativo, ISSRResumen
En el marco del programa de desarrollo de germoplasma ornamental nativo del INTA se incluyó el estudio del género Mecardonia. El género en cuestión se caracteriza por su forma compacta, la variabilidad en el tamaño y color de sus flores, su largo período de floración y su fácil propagación. Con la finalidad de estimar la diversidad genética presente en veinticinco individuos pertenecientes a dos especies del género Mecardonia, se emplearon siete microsatélites anclados, los cuales generaron un total de 557 loci polimórficos, con un promedio de 80 loci por iniciador. Los valores de Rp variaron entre 11,923 y 25,231; el promedio del PIC fue de 0,130 y el MI varió de 5,875 a 12,160. A partir de la matriz de similitud genética entre individuos, obtenida mediante la aplicación del coeficiente de Dice y el análisis de agrupamiento (UPGMA) se construyó un fenograma que permitió separar a los 25 individuos en 3 grupos bien definidos, uno de los cuales incluye a los individuos de M. procumbens var. tenella, otro agrupa a los individuos de M. procumbens var. flagellaris, mientras que el último incluye a los individuos de Mecardonia sp junto a individuos de M. procumbens var. Flagellaris. Se calculó un valor de coeficiente de correlación cofenética de r=0,99 entre la matriz de similitud y el fenograma generado. Los resultados obtenidos en este trabajo permitieron diferenciar inequívocamente la totalidad de los individuos analizados, pudiéndose inferir un alto grado de variabilidad en la población bajo estudio. Los ISSRs constituyen una herramienta molecular eficaz cuando se requiera una manipulación simple, confiable y de bajo costo.
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Referencias
Alderete, L., Mori, M., Kato, A. & Escandón, A. 2006. Establishment of an in vitro micropropagation protocol for Mecardonia tenella. Electronic Journal of Biotechnology Vol. 9 No. 3, Special Issue. ISSN: 0717-3458E. DOI: 10.2225/vol9-issue3-fulltext-6
Azofeifa-Delgado, A. 2006. Uso de marcadores moleculares en plantas; aplicaciones en frutales del trópico. Agronomía Mesoamericana 17(2): 221-242. ISSN: 1021-7444.
Bao, J., Corke, H. & Sun, M. 2006. Analysis of genetic diversity and relationships in waxy rice (Oryza sativa L.) using AFLP and ISSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution 53:323-330. DOI 10.1007 /s10722-004-6145-6.
Bhatia, R., Singh, K.P., Jhang T., Sharma, T.R. 2009. Assessment of clonal fidelity of micropropagated gerbera plants by ISSR markers. Scientia Horticulturae 119: 208-211
Blair, M.W., Panaud, O. & Mc Couch, S.R. 1999. Intersimple sequence repeat amplification for analysis of microsatellite motif frequency and fingerprinting in rice (Oryza sativa L.) Theoretical Applied Genetics 98: 780-792.
Cubero, J. I. 2003. Introducción a la mejora genética vegetal. Mundi-Prensa Libros. ISBN 8484760995,9788484760993. 565 pp.
CIMMYT. 2005. Laboratory Protocols: CIMMYT Applied Molecular Genetics Laboratory. Third Edition. Mexico, D.F. ISBN: 968-6923-30-6.
Dawson, G. 1979. Scrophulariaceae. En A. Burkart ed. Fl. II. Entre Ríos, Colecc. Ci. Inst. Nac. Tecnol. Agropecu. 6 (5a):452-504.
Dice, L. R. 1945. Measures of the amount of ecologic association between species. Ecology, 26:297-302.
Escandón, A.S., Marinangeli, P. y Pérez de la Torre, M. 2010. Parte V Capítulo 4. Avances de la biotecnología en cultivos ornamentales. En: Echenique, V.; Hopp, E.; Rubinstein, C. Y Mroginsky, L. eds. Biotecnología y Mejoramiento Vegetal II ed. INTA, Buenos Aires, Argentina. En prensa.
Escandón, A., Miyajima, I., Alderete, M., Hagiwara, J.C., Facciuto, G., Mata, D. & Soto, M.S. 2005a. Wild ornamental germplasm exploration and domestication based on biotechnological approaches. In vitro colchicine treatment to obtain a new cultivar of Scoparia montevidiensis. Electronic Journal of Biotechnology. Vol. 8 No. 2, Issue of August 15. ISSN: 0717-3458. DOI: 10.2225/vol8-issue2-fulltext-2.
Escandón, A. S., Pérez de la Torre, M., Acevedo, A., Marcucci-Poltri, S. & Miyajima, I. 2005b. Anchored ISSR as molecular marker to characterize accessions of Jacaranda mimosifolia L. Don. Proceedings of Vth on New Flor. Crops. ISHS. A.F.C. Tombolato & G:M. DiasTagliacozzo eds. Acta Horticulturae 683. pp. 121-127.
Escandón, A. S., Pérez de la Torre, M., Soto, M. & Zelener, N. 2005c. Identificación de clones selectos de Nierembergia linariaefolia mediante microsatélites anclados. Revista de Investigación Agropecuaria: 34 (1): 3-15.
Escandón, A., Hagiwara, J.C., Alderete, L. 2006. A new variety of Bacopa monnieri obtained by in vitro polyploidization. Electronic Journal of Biotechnology. Vol.9 No.3, Special Issue. ISSN: 0717-3458. DOI: 10.2225/vol9-issue3-fulltext-8.
Escandón, A., Alderete, L. & Hagiwara, J.C. 2007a. A new variety of Mecardonia tenella, a native plant from South America with ornamental potential, obtained by in vitro polyploidization. Scientia Horticulturae 115: 56-61.
Escandón, A., Zelener, N., Pérez de la Torre, M., Soto, S. 2007b. Molecular identification of new varieties of Nierembergia linariaefolia, a native Argentinean ornamental plant. J. Appl. Genet. 48(2), 115-123.
García-Mas, J. Graziano E., Aranzana M.J., Monforte, A., Oliver, M., Ballester, J., Viruel, M.A. y Arús, P. 2000. Capítulo 3. Marcadores de AND: Concepto, tipos, protocolos. Nuez F. y Carrillo J.M. Eds. Editorial U.P.V. ISBN 84-7721-945-1.
Gupta, P.K., Varshney, R.K., Sharma, P.C. & Armes, B. 1999. Molecular markers and their applications in wheat breeding. Plant Breeding 118: 369-390. ISSN 0179-954.
Hundsdoerfer A. & Wink, M. 2005. New Source of Genetic Polymorphisms in Lepidoptera? Z. Naturforsch. 60c, 618-624. 0939-5075/2005/0700-0618
Jain, A., Apparanda, C. & Bhalla, P. 1999. Evaluation of genetic diversity and genome fingerprinting of Pandorea (Bignoniacea) by RAPD and inter-SSR PCR. Genome 42: 714-719.
Joshi, S.P. Gupta, V.S. Aggarwal, R.K, Ranjekar, P.K. & Brar, D.S. 2000. Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism in the genus Oryza. Theor. Appl. Genet. 100:1311-1320
Manimekalai, R. & Nagarajan, P. 2006. Assessing genetic relationships among coconut (Cocos nucifera L.) accessions using inter simple sequence repeat markers. Scientia Horticulturae 108: 49–54
Mantel, N.A. 1967. The detection of disease clustering and a generalized regression approach. Cancer Res. 27, 209–220.
Maritano, P.; Alderete, L; Pérez de la Torre, M. & Escandón, A. 2010. In vitro propagation and genetic stability análisis of Evolvulus spp. Biotechnological tools for the exploration of native germplasm with ornamental potential. In Vitro and Cell Dev.: 46 (1): 64-70. DOI 10.1007/s11627-009-9238-2.
Muthusamy, S., Kanagarajan, S. & Ponnusamy, S. 2008. Efficiency of RAPD and ISSR markers system in accessing genetic variation of rice bean (Vigna umbellata) landraces. Electronic Journal of Biotechnology Vol. 11 No. 3, Issue of July 15, 2008. ISSN: 0717-3458. DOI: 10.2225/vol11-issue3-fulltext-8
Nuez F., Carrillo, J.M. y de Ron A.M. 2000. Capítulo 1. Introducción. Los marcadores genéticos en la mejora vegetal. Nuez F. y Carrillo J.M. Eds. Editorial U.P.V. ISBN 84-7721-945-1.
Nybom, H. 2004. Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants. Molecular Ecology 13, 1143–1155 doi: 10.1111 /j.1365-294X.2004.02141.x
Pérez de la Torre, M., Acevedo, A., Serpa, J.C., Miyajima, I. & Escandón, A.S. 2003. Puesta a punto de la técnica de microsatélites anclados para la caracterización de individuos selectos de Jacarandá. En: Floricultura en la Argentina. Investigación y Tecnología de producción. Mascarini, L. Vilella, F. y Wright. E, eds. pp: 3-12.
Pérez de la Torre, M., Escandón, A. 2006. Construction of a molecular identification profile of new varieties of Nierembergia linariaefolia by anchored microsatellites. Electronic Journal of Biotechnology. EJB, Vol.9 No.3, Special Issue, 2006. ISSN: 0717-3458. DOI: 10.2225/vol9-issue3-17.
Powell, W., Morgante, R., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S., Rafalsky, A. 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Mol. Breed. 2: 225-238.
Pradeep Reddy, M.; Sarla, N. and Siddiq E.A. 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica. 128: 9-17.
Prevost, A. & Wilkinson, M.J. 1999. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theoretical Applied Genetics: 98: 107-112.
Rakoczy-Trojanowska, M. & Bolibok, H. 2004. Characteristics and a comparison of three classes of Microsatellite-based markers and their application in plants. Cellular & Molecular Biology Letters. Volume 9, 221 – 238.
Rohlf, F.J. 1998. NTSYS-pc Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.02. Exeter Publishing Ltd., Setauket, New York, USA.
Rossow, R.A. 1987. Revisión del género Mecardonia (Scrophulariaceae). Candollea 42(2): 431-474
Sica, M., Gamba, G., Montieri, S., Gaudio, L. & Aceto, S. 2005. ISSR markers show differentiation among Italian populations of Asparagus acutifolius L. BMC Genetics, 6:17 doi: 10.1186/1471-2156-6-17
Smith, J.S.C., Chin, E.C.L., Shu, O.S., Wall, S.J., Senior, M.L., Mitchel, S.E., Kresovich, S. & Ziegle, J. 1997. An evaluation of SSR loci as molecular markers in maize (Zea mays L.): comparison with data from AFLPs and pedigree. Theor. Appl. Genet. 95: 163–173.
Souza, V.C. 1997. Consideraciones sobre la delimitación de Mecardonia procumbens (Mill.) Small (Scrophulariaceae). Acta Bot. Bras. 11 (2): 181-189.
Spooner, D.; van Treuren, R. & de Vicente, M. C. 2005. Molecular markers for genebank management. IPGRI Technical bulletin Nº 10. International Plant Genetic Resources Institute.
Sudupak, M.E. 2004. Inter and intra-species Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) variations in the genus Cicer. Euphytica 135:229-238.
UBC Primer set #9. Universidad de la Columbia Británica. Vancouver, Canadá.
Vaccaro, M. S.; Pérez de la Torre, M. C. & Escandón, A. S. 2008. Ensayos preliminares para el establecimiento de un protocolo de micropropagación in vitro de Glandularia peruviana (L.) Small. y evaluación de la estabilidad genética. 4º Congreso Argentino de Floricultura y Plantas Ornamentales. 10ª Jornadas Nacionales de Floricultura. pp: 502-507.
Weising, K., Nybon, H., Wolff, K. & Kahl, G. 2005. Applications of DNA Fingerprinting in Plant Sciences. In DNA Fingerprinting in Plants. Principles , Methods and Applications (2nd edition). Taylor and Francis, Eds. CRC Press Boca Raton, London, New York, Singapore. 444 pp.
Xue-Jun Ge, Yan Yu, Yong-Ming Yuan, Hong-Wen Huang & Cheng Yan. 2005. Genetic Diversity and Geographic Differentiation in Endangered Ammopiptanthus (Leguminosae) Populations in Desert Regions of Northwest China as Revealed by ISSR Analysis. Annals of Botany 95: 843–851. doi:10.1093/aob/mci089
Yang, W., Glover, B., Rao, G. & Yang, J. 2006. Molecular evidence for multiple polyploidization and 29 lineage recombination in the Chrysanthemum indicum polyploid complex (Asteraceae). New Phytologist 171: 875–886. doi: 10.1111/j.1469-8137.2006.01779.x
Zelener, N., Marcucci Poltri, S.N., Bartoloni, N., López, C.R. & Hopp, H.E. 2005. Selection strategy for a seedling seed orchard design based on both, trait selection index and genomic analysis by molecular markers: a case study for Eucalyptus dunnii. Tree Physiology 25: 625-632.
Zietkiewicz, E., Rafalski, A. & Labuda, D. 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymorphism chain reaction amplification. Genomics: 20: 176-183.
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